基础医学院创建于1965年，前身为湖北医学院咸宁分院基础医学部。现有建筑面积11000平方米，教学科研仪器设备2900余万元；下设10个教研室、1个省级实验教学示范中心、1个省级生命科学标本陈列馆；现有教职工94人，其中专任教师70人，包括教授11人、副教授27人、博士31人。学院聘有高层次人才4人，教师中省政府特殊津贴专家、市高层次人才4人，湖北名师1人，硕士生导师21人。

学院尊崇“厚德仁心、强基固本”办学宗旨，弘扬“传帮带、教学研”优良传统。开设临床医学本科专业，同时承担药学、口腔医学、护理学等其它13个本专科专业和药学专业硕士的医学基础课教学任务；建设有省级教学团队2个、省级基层教学组织1个；获批国家一流课程1门，国家级虚拟仿真实验教学项目1项，省级一流课程8门；承担省级教学研究项目10余项，荣获省级以上教学大赛奖励12项、省级教学成果二等奖1项，教师发表教研论文20余篇，出版主、参编教材及教学参考书20多部。

学院坚持“学科引领、人才驱动、质量优先、特色彰显”发展思路，促进内涵式高质量发展。建设有咸宁市健康环境工程技术研究中心、环境疾病与全健康学校重点实验室，创新团队5个。近年来承担各类研究项目200余项，其中国家级项目15项，研究经费2000多万元；获国家民委社会科学研究三等奖1项，湖北省科技奖励二等奖2项，湖北省科技进步三等奖1项；发表科研论文500余篇，其中被SCI收录100余篇；每年培养硕士研究生20余人。

学院践行“厚基础、重实践、崇创新、强能力”育人理念，培养高素质医学人才。学生近三年获批国家、省级大学生创新创业项目30余项，发表研究论文50余篇，参加各类学科竞赛获国赛二等奖1项、省级特等奖1项、一等奖4项、二等奖4项、三等奖57。学院累计向国家和社会输送2万余名高级医学人才，为我国尤其是鄂东南地区的医疗卫生事业发展做出了重要贡献。